Più di 5.000 nuovi tipi di virus sono stati identificati negli oceani del mondo, secondo un nuovo studio.
I ricercatori dello studio hanno analizzato decine di migliaia di campioni d’acqua provenienti da tutto il mondo, alla ricerca di virus a RNA o virus che utilizzano RNA come materiale ereditario. Il nuovo coronavirus, ad esempio, è un tipo di virus a RNA. Questi virus sono studiati rispetto ai virus del DNA che utilizzano DNA Come materiale genetico, hanno detto gli autori.
La diversità dei virus scoperti di recente era così grande che i ricercatori hanno suggerito di raddoppiare il numero di gruppi tassonomici necessari per classificare i virus a RNA, dagli attuali cinque a 10 phyla. (L’era è un’ampia classificazione in biologia che rientra in “regno.”)
“C’è molta nuova varietà qui – e una completa diversità [new] Un phylum, Taraviricota, si trova in tutti gli oceani, indicando che è ecologicamente importante”, ha detto l’autore principale dello studio Matthew Sullivan, professore di microbiologia alla Ohio State University. Ha detto in una dichiarazione (Si apre in una nuova scheda).
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Secondo Sullivan, gli studi sui virus a RNA si sono in genere concentrati su quelli che causano malattie. (Alcuni noti virus a RNA includono l’influenza, l’ebola e il coronavirus che causa COVID-19.) Ma questa è solo una “piccola fetta” di virus a RNA sulla Terra, ha detto Sullivan.
“Volevamo studiarlo sistematicamente su larga scala ed esplorare un ambiente che nessuno aveva esaminato in profondità”, ha affermato Sullivan nella dichiarazione.
Per lo studio pubblicato giovedì (7 aprile) sulla rivista Scienza (Si apre in una nuova scheda)Nello studio, i ricercatori hanno analizzato 35.000 campioni d’acqua prelevati da 121 siti in tutti e cinque gli oceani del mondo. I ricercatori fanno parte del Tara Ocean Consortium, un progetto globale per studiarne l’impatto Cambiamento climatico sull’oceano.
I ricercatori hanno affermato di aver esaminato le sequenze genetiche estratte da piccoli organismi acquatici noti come plancton, che sono ospiti comuni dei virus a RNA. Si sono stabiliti su sequenze appartenenti ai virus a RNA cercando un gene antico chiamato RdRp, che si trova in tutti i virus a RNA ma è assente da altri virus e cellule. Hanno identificato più di 44.000 sequenze con questo gene.
Ma il gene RdRp ha miliardi di anni e si è evoluto molte volte. Poiché l’evoluzione del gene risale a molto tempo fa, è stato difficile per i ricercatori determinare la relazione evolutiva tra le sequenze. Quindi i ricercatori hanno utilizzato l’apprendimento automatico per organizzarli.
Complessivamente, hanno identificato circa 5.500 nuove specie di virus a RNA che rientravano nelle cinque classi esistenti, oltre alle cinque nuove classi proposte, che i ricercatori hanno chiamato Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota e Arctiviricota.
Le specie di virus nel phylum Taraviricota erano particolarmente abbondanti nelle acque temperate e tropicali, mentre i virus nel phylum Arctiviricota sono abbondanti nell’Oceano Artico, scrivono i ricercatori in Conversazione. (Si apre in una nuova scheda)
Comprendere come il gene RdRp varia nel tempo può portare a una migliore comprensione di come si sviluppa la vita in anticipo SbarcareDissero gli autori.
“Si presume che RdRp sia uno dei geni più antichi: era presente prima che fosse necessario il DNA”, ha affermato nella dichiarazione il co-primo autore dello studio Ahmed Zayed, ricercatore in microbiologia dello stato dell’Ohio. Quindi tracciamo non solo l’origine dei virus, ma anche le origini della vita.
Originariamente pubblicato su Live Science.
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